上海瑞金医院 （上海市瑞金二路197号）

设有重点学科骨科、内分泌代谢病科、肾脏科、外科、消化内科、血液科、灼伤整形科、儿科、耳鼻咽喉科、妇产科、感染科、核医学科、呼吸科、康复医学科、泌尿科、神内外科、心血管内科、肿瘤放化疗科等也颇具特色。

上海华山医院（上海市乌鲁木齐中路12号）

神经外科、手外科、神经病学、传染病学、中西医结合临床、泌尿外科、肾病科、心血管科、影像医学、核医学、普外科、抗生素研究所、放射科、检验医学均为重点学科；皮肤科、骨科、运动医学科、康复科、急救医学科、内分泌科、护理学科、药剂科等为该院的特色学科。

上海中山医院（上海市徐汇区枫林路180号）

设有除小儿科以外的所有科室，其中心脏、肝癌、肾脏和肺部疾病诊治是医院的重点和特色，腹部外科、骨科、介入放射、麻醉科、超声诊断和中西医结合等科室皆颇具特色。

上海市第一人民医院（武进路85号）

在眼科、肾移植、肝移植、造血干细胞移植等有突出成绩。此外，医院的普外科、心外科、心内科、泌尿外科、血液科、放射科、肾内科、耳鼻喉-头颈外科、妇产科、骨科、消化科等在国内也具有很强的竞争力。

上海仁济医院（（东院）上海市东方路1630号）

有消化科、风湿科、神经外科、妇科、心内科、泌尿外科、麻醉科、心胸外科、肾脏科、器官移植科等特色科室。

上海肿瘤医院（上海市东安路270号）

在肿瘤学、乳腺癌、病理学、放射治疗、大肠癌等方面颇具特色。

上海市肺科医院（上海市杨浦区政民路507号）

拥有普胸外科、肺部肿瘤、呼吸系统常见病和疑难危重疾病、肺结核及职业病等特色学科和专业。

上海胸科医院（上海市徐汇区淮海西路241号）

医院开展的心脏、肺、胸骨移植术、“冠心搭桥术”，心脏单、双瓣膜置换术、各种心脏复杂畸形的诊断和纠治等均居国内先进水平；肺癌的早期发现和综合治疗、气管术式的创新等居国际先进水平。

上海妇产科医院（上海市方斜路419号）

集妇科、产科、中西医结合科、计划生育科、新生儿科、妇产科研究所等于一身的全国知名大型妇产科专科医疗机构。

上海眼耳鼻喉科医院（上海徐汇区汾阳路83号）

该院耳鼻喉科是我国规模最大的耳鼻喉学科之一，眼科是我国最重要的眼科医教研基地之一。

上海长海医院（上海杨浦区长海路168号）

有肝胆外科、胸心外科、烧伤外科、创伤外科、血液内科、消化内科等特色学科。

上海长征医院（上海市黄浦区凤阳路415号）

形成了骨科伤病、神经外科伤病、器官移植、肾病、皮肤真菌病、多发伤及多脏器功能障碍综合症的救治等20多个医疗特色。

中国人民解放军第八五医院（上海市长宁区华山路1328号）

神经内科、肺科、传染科、伽玛刀治疗中心、手（足）外科等在驻地及上海周边地区具有相当的知名度。

解放军第四五五医院（淮海西路338号）

胆道外科为该院特色领先专科，并在心血管疾病、脑中风、手外科断指再植手术、眼科白内障手术等方面也具有知名度。

东方肝胆外科医院（上海市长海路225号）

在原发性肝癌的早期诊断和治疗，中晚期肝癌的综合治疗，原发性肝癌术后抗复发治疗，肿瘤的免疫治疗、介入治疗，复杂胆道疾病的手术治疗，肝胆疾病的内窥镜治疗，以及肝移植等方面均居国内外先进水平。

上海新华医院（上海市杨浦区控江路1665号）

医院的心血管内科、消化内科、神经内科、普外科、心胸外科、神经外科、泌尿外科、骨科、儿科学、儿外科学、眼科、耳鼻咽喉—头颈外科、皮肤科、临床营养中心等学科综合实力一流。

上海市第六人民医院（上海市宜山路600号）

该院的骨外科、内分泌与代谢病学、心血管病学是国家级重点学科，并在四肢显微外科、内分泌代谢科、介入影像学、遗传学、泌尿外科、耳鼻咽喉科、超声医学科、血液内科、心血管内科、普通外科、麻醉科、妇产科等学科上也颇有优势。

上海市东方医院（上海市浦东新区即墨路150号）

该院心胸外科、心血管介入、脊柱外科、运动医学科、心身医学科、口腔种植修复、微创外科、血管外科和急诊创伤等成为医院的特色医疗项目。其中心力衰竭救治、口腔种植等技术已成为上海市医学重点专科项目。

上海和平眼科医院（上海市虹口区伊敏河路61号）

医院现有视网膜眼底病、糖网病、眼表病、青光眼、白内障、小儿斜弱视、青少年屈光不正、中医眼科、泪道疾病等九个专业科室。治疗高难度视网膜眼底病、难治青光眼、复杂白内障及角膜眼表疾病已成为强项。　　

上海市医药大学附属龙华医院（上海市徐汇区宛平南路725号）

医院的中医特色鲜明，中医药在治疗恶性肿瘤、骨退行性病变、肾病、胆石病、风湿病、眼病、乳腺病、肛肠病、脾胃病、肺病、疮疡病等有显著的疗效；同时医院有冬令进补膏方门诊、冬病夏治门诊、中医特色体检门诊等。

上海市中西医结合医院（上海市虹口区保定路230号）

建院70多年来，已拥有1个全国医疗中心、3个上海市医疗中心、2个上海市领先医疗特色专科、4个虹口医疗品牌建设专科，另有特色专科10多个。

上海市浦东新区光明中医医院（上海市南汇区惠南镇东门大街43号）

医院设有内科、外科、妇产科、儿科、痔瘘科、眼科、耳鼻喉科、皮肤科、针灸科、推拿科、伤骨科、口腔科和急诊科、ICU等十多个临床科室及放射、检验、病理、理疗、B超、心电图、内窥镜等辅助检查科室。